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A/O法存在的问题
(1)由于没有独立的污泥回流系统，从而不能培养出具有独特功能的污泥，难降解物质的降解率较低;
(2)若要提高脱氮效率，必须加大内循环比，因而加大运行费用。从外，内循环液来自曝气池，含有一定的DO，使A段难以保持理想的缺氧状态，影响反硝化效果，脱氮率很难达到90% 。
污水脱氮的影响因素
1、酸碱度(pH值)
大量研究表明，氨氧化菌和亚硝酸盐氧化菌的适宜的pH分别为7.0～8.5和6.0～7.5，当pH值低于6.0或高于9.6时，硝化反应停止。硝化细菌经过一段时间驯化后，可在低pH值(5.5)的条件下进行，但pH值突然降低，则会使硝化反应速度骤降，待pH值升高恢复后，硝化反应也会随之恢复。
反硝化细菌最适宜的pH值为7.0～8.5，在这个pH值下反硝化速率较高，当pH值低于6.0或高于8.5时，反硝化速率将明显降低。此外pH值还影响反硝化最终产物，pH值超过7.3时终产物为氮气，低于7.3时终产物是N2O。
硝化过程消耗废水中的碱度会使废水的pH值下降(每硝化1g氨氮将消耗7.14g碱度，以CaCO3计)。相反，反硝化过程则会产生一定量的碱度使pH值上升(每反硝化1g硝酸盐将产生3.57g碱度，以CaCO3计)但是由于硝化反应和反硝化过程是序列进行的，也就是说反硝化阶段产生的碱度并不能弥补硝化阶段所消耗的碱度。因此，为使脱氮系统处于最佳状态，应及时调整pH值。
2、温度(T)
硝化反应适宜的温度范围为5～35℃，在5～35℃范围内，反应速度随温度升高而加快，当温度小于5℃时，硝化菌完全停止活动;在同时去除COD和硝化反应体系中，温度小于15℃时，硝化反应速度会迅速降低，对硝酸菌的抑制会更加强烈。
反硝化反应适宜的温度是15～30℃，当温度低于10℃时，反硝化作用停止，当温度高于30℃时，反硝化速率也开始下降。
有研究表明，温度对反硝化速率的影响取与反应设备的类型、负荷率的高低都有直接的关系，不同碳源条件下，不同温度对反硝化速率的影响也不同。
3、溶解氧(DO)
在好氧条件下硝化反应才能进行，溶解氧浓度不但影响硝化反应速率，而且影响其代谢产物。为满足正常的硝化反应，在活性污泥中，溶解氧的浓度至少要有2mg/L，一般应在2～3mg/L，生物膜法则应大于3mg/L。当溶解氧的浓度低于0.5～0.7mg/L时，硝化反应过程将受到限制。
氮去除机制及相关菌属相对丰度变化 不同进水比例下NO3--N和NH4+-N在反应器内的沿程变化如图 5所示.从图 5(a)中可以看出, NO3--N的去除主要发生在反应器内缺氧区, 且在相同的HRT(3.5 h)内, 缺氧区去除的NO3--N随着其进水流量分配比例的增大而增加.通过反硝化速率测定试验可以得出, 从阶段Ⅰ~Ⅴ系统缺氧区反硝化速率分别为2.14、2.44、3.15、3.56和3.86mg·(g·h)-1.因此, 与传统厌氧区单段进水的模式相比, 预缺氧、厌氧两段和预缺氧、厌氧及缺氧三段进水的模式可极大程度地提高A2/O系统的反硝化性能, 从而保证系统TN的去除效率.从图 5(b)中可以看出, NH4+-N的去除主要发生在反应器内好氧区, 且不同的进水模式对A2/O系统的硝化性能影响不大, 系统在各个阶段均具有较强的硝化性能.结果表明, 氮在系统内的去除主要是通过传统的好氧硝化作用和缺氧反硝化作用完成的, 预缺氧、厌氧及缺氧三段进水的模式可极大程度地提高A2/O系统的反硝化性能, 从而保证了TN的去除效率.
通过对各阶段好氧区活性污泥16S rRNA基因测序数据的梳理, 发现了系统内有4类反硝化细菌在属水平上的相对丰度随着试验的进行而得到较明显的提升, 如表 4所示.可以看出, 与传统厌氧区单段进水的模式相比, 预缺氧、厌氧两段和预缺氧、厌氧及缺氧三段进水的模式可提高缺氧区反硝化细菌的代谢活性, 从而使Pseudomonas、Thauera、Denitratisoma和Thermomonas在属水平上的相对丰度得到不同程度提高.阶段Ⅴ的进水模式更有利于这4类反硝化菌属的富集, 其相对丰度总和与阶段Ⅰ相比提高了42.86%.因此, 预缺氧、厌氧及缺氧三段进水的模式更有利于这4类反硝化菌属的富集, 这与系统较强的反硝化性能密切相关.